Der Managed Domain Service ist ein proprietäres SEPPmail Add-On zur Domänenverschlüsselung. Dabei werden für teilnehmende Kunden die auf jedem SEPPmail Secure E-Mail Gateway dediziert für diesen Service automatisch generierten öffentlichen S/MIME Domänenschlüssel automatisiert zwischen allen SEPPmail Secure E-Mail Gateways und deren OEM Derivaten ausgetauscht. Somit steht in der Regel zwischen SEPPmail Secure E-Mail Gateways grundsätzlich die Domänenverschlüsselung automatisch zur Verfügung.
Zusätzlich werden beim SEPPmail Managed Domain Service die Betreffzeilen von E-Mails verschlüsselt. Dies ist möglich, da bereits beim Versand einer E-Mail bekannt ist, dass auf der Gegenstelle ebenfalls ein SEPPmail Secure E-Mail Gateway für das Ausführen kryptographischer Aktionen vorhanden ist.
Der SEPPmail Managed Domain Service steht im Rahmen der Domänenverschlüsselung bereits über die Basis Lizenz (siehe Basissysteme und Lizenz) allen Absendern zur Verfügung. Eine Lizenz für Signatur und Verschlüsselung ist hierfür nicht erforderlich.