Das System sucht regelmäßig automatisch nach anstehenden Versionsupdates und Patches. Steht ein Update bereit, so wird dies in der Administrationsoberfläche angezeigt. Weiterhin wird der Administrator per E-Mail darüber benachrichtigt. Dieser entscheidet, ob er das Update nur abholen und beim nächsten Systemstart oder sofort installieren möchte.
Nachdem das SEPPmail Secure E-Mail Gateway Firmware ist, wird bei einem Update immer das gesamte Core-System ausgetauscht. Dies schließt Kompatibilitätsprobleme zwischen einzelnen, benötigten Komponenten, wie zum Beispiel Datenbanken und Modulen aus und macht das System test- und reproduzierbar.
Konfiguration und Schlüsselmaterial bleiben beim Update Vorgang natürlich erhalten.
Im Cluster-Betrieb können die einzelnen Cluster Partner im laufenden Betrieb nacheinander - und somit ohne Unterbrechen des E-Mail Verkehrs - aktualisiert werden.