Im Standard ist mit dem Einrichten einer E-Mail Domäne (Managed Domain) über den sogenannten SEPPmail Managed Domain Service bereits die Domänenverschlüsselung zu jeder externen E-Mail Domäne möglich, die ebenfalls ein SEPPmail Produkt im Einsatz hat.
Welche Zieldomänen am Service teilnehmen, kann bei Bedarf über die Suchfunktion Search for managed S/MIME certificate des Menüs Domain Certificates festgestellt werden.
Weiterhin besteht optional die Möglichkeit des manuellen Einrichtens von Domänenverschlüsselungen zu Drittanbietersystemen. Dies ist mittels S/MIME über die Schaltfläche S/MIME domain certificates..., beziehungsweis mittels OpenPGP über OpenPGP domain keys... möglich.